RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.6□□□□□ -0.55
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CS-217ENST00000550044 PDE1AP54750 535 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 NUCB1Q02818 461 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 IRF5Q13568 498 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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CS-217ENST00000550044 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.6□□□□□ -0.55
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CS-217ENST00000550044 UBE3CQ15386 1083 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 CERS3Q8IU89 383 aa11.58□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.57□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 COA7Q96BR5 231 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 FSD1Q9BTV5 496 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 DOCK2Q92608 1830 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 MUC3AQ02505 3323 aa11.56□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 HMGCRP04035 888 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 SLC4A3P48751 1232 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 PLCD1P51178 756 aa11.56□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.56□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 CDH23Q9H251 3354 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 HLA-DOAP06340 250 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 PTPRAP18433 802 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 TRIM32Q13049 653 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.55□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 APPBP2Q92624 585 aa11.55□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 PFASO15067 1338 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 M0R2C6 588 aa11.54□□□□□ -0.56
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CS-217ENST00000550044 JAG1P78504 1218 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 TREML4Q6UXN2 200 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 DNAJC18Q9H819 358 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-217ENST00000550044 DOCK1Q14185 1865 aa11.53□□□□□ -0.56
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