RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 HOXC6P09630 235 aa29.72■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 ADORA2AP29274 412 aa29.72■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 PDE4BQ07343 736 aa29.72■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.72■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 F5H6K3 240 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 EVI5O60447 810 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 KLRC3Q07444 240 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 PPARAQ07869 468 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 NBPF3Q9H094 633 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa29.7■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 TSPY3P0CV98 308 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 TSPY8P0CW00 308 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 CNGA1P29973 690 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 CEP95Q96GE4 821 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 VWA5AO00534 786 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC25A27O95847 323 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 NDUFB10O96000 172 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 CYP2C19P33261 490 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 SMC5Q8IY18 1101 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 FCER1AP12319 257 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 TFAP4Q01664 338 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 LHX8Q68G74 356 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 CHRDL2Q6WN34 429 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 SLF1Q9BQI6 1058 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 HELLSQ9NRZ9 838 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 COBLO75128 1261 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 TTLL1O95922 423 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 IGHDP01880 384 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 STAT3P40763 770 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 ABRAQ8N0Z2 381 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 VPS53Q5VIR6 699 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 MKL1Q969V6 931 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 RILPL2Q969X0 211 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 A0A0G2JMZ2 1700 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 FOXP2O15409 715 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM227BQ96M60 508 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRJ-206ENST00000534219 RLFQ13129 1914 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 MMP19Q99542 508 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 KCTD2Q14681 263 aa29.62■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa29.62■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 A0A0D9SFI3 127 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 TSPY2A6NKD2 308 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 MSCO60682 206 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 COPB2P35606 906 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC4A3P48751 1232 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 NUCB1Q02818 461 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 REPS2Q8NFH8 660 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 KIFC2Q96AC6 838 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 INCENPQ9NQS7 918 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 ZBED4O75132 1171 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 SLFN13Q68D06 897 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 TICAM2Q86XR7 235 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 TRPV1Q8NER1 839 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 MAML3Q96JK9 1138 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 CEP290O15078 2479 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 IGHA2P01877 340 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 CYBAP13498 195 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 FEM1BQ9UK73 627 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 STX8Q9UNK0 236 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 PGK2P07205 417 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 BMP3P12645 472 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 ALX1Q15699 326 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRJ-206ENST00000534219 CPXCR1Q8N123 301 aa29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms