RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.55■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.54■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.54■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 COBLO75128 1261 aa22.54■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 CYBAP13498 195 aa22.54■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 GNAT2P19087 354 aa22.54■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 CYP2C19P33261 490 aa22.54■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 MCM3APO60318 1980 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 STRNO43815 780 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 ATP2B2Q01814 1243 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 NYAP2Q9P242 653 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.53■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 TDO2P48775 406 aa22.52■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.52■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.52■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 FSD1Q9BTV5 496 aa22.52■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 MROH8Q9H579 483 aa22.52■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 GOPCQ9HD26 462 aa22.52■■□□□ 1.2
CTTN-211ENST00000527622 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.51■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 VWA5AO00534 786 aa22.5■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 PRDM1O75626 825 aa22.5■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 NDUFB10O96000 172 aa22.5■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 PLS1Q14651 629 aa22.5■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.5■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.5■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 STAP2Q9UGK3 403 aa22.5■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 DPP9Q86TI2 863 aa22.49■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.49■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 CEP95Q96GE4 821 aa22.49■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 GDF15Q99988 308 aa22.49■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 LTBP2Q14767 1821 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 COL6A3P12111 3177 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 F5H6K3 240 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 SLC25A27O95847 323 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 KLRC3Q07444 240 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 MKL1Q969V6 931 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 MAML3Q96JK9 1138 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 APPP05067 770 aa22.47■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 PDE1AP54750 535 aa22.47■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.47■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.47■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 A0A1W2PPC1 479 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 MSCO60682 206 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 STAT3P40763 770 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 PPARAQ07869 468 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.46■■□□□ 1.19
CTTN-211ENST00000527622 FCER1AP12319 257 aa22.45■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 VPS53Q5VIR6 699 aa22.45■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.45■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 NAPBQ9H115 298 aa22.45■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 RAD21O60216 631 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 PGK2P07205 417 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 SYN1P17600 705 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 CNGA1P29973 690 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 LAMA4Q16363 1823 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 MMP19Q99542 508 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.44■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 LCTP09848 1927 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 DNM1LO00429 736 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 ATP2A1O14983 1001 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 SEPT4O43236 478 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 BMP8BP34820 402 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 SMC5Q8IY18 1101 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 EVI5LQ96CN4 794 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 RIPK3Q9Y572 518 aa22.43■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 TTLL1O95922 423 aa22.42■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 COPB2P35606 906 aa22.42■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 PDE4BQ07343 736 aa22.42■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.42■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 A0A0D9SFI3 127 aa22.41■■□□□ 1.18
CTTN-211ENST00000527622 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms