RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527267.1

TMEM25-215, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 3

Gene TMEM25, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-215	ENST00000527267	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	RAB11FIP3	O75154	756 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	PGK2	P07205	417 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	SHH	Q15465	462 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	TRIM60	Q495X7	471 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	CCDC17	Q96LX7	622 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	HAUS7	Q99871	368 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		19	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	KBTBD13	C9JR72	458 aa		18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	HMMR	O75330	724 aa		18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	CTR9	Q6PD62	1173 aa		18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		18.99	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	FCER1A	P12319	257 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	SNX17	Q15036	470 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	BAD	Q92934	168 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		18.98	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	UBE3C	Q15386	1083 aa		18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	REPS2	Q8NFH8	660 aa		18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	MMP19	Q99542	508 aa		18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	SH2D4A	Q9H788	454 aa		18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		18.97	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	VWA5A	O00534	786 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	RAD21	O60216	631 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	PGK1	P00558	417 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	ITGB8	P26012	769 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
TMEM25-215	ENST00000527267	SLC25A27	O95847	323 aa		18.95	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	MS4A1	P11836	297 aa		18.95	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	STAT3	P40763	770 aa		18.95	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	TLE2	Q04725	743 aa		18.95	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		18.95	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	TINF2	Q9BSI4	451 aa		18.95	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	PHF24	Q9UPV7	400 aa		18.95	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		18.94	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		18.93	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	RASA1	P20936	1047 aa		18.93	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	EPHB4	P54760	987 aa		18.93	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	RIPK3	Q9Y572	518 aa		18.93	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	MCM3AP	O60318	1980 aa		18.93	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	RARB	P10826	455 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	KCTD2	Q14681	263 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	OSBP2	Q969R2	916 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	GOPC	Q9HD26	462 aa		18.92	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	MYO9B	Q13459	2157 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267		A0A1W2PQY0	241 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	NDUFB10	O96000	172 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	SBK1	Q52WX2	424 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	MYH4	Q9Y623	1939 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TMEM25-215	ENST00000527267	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		18.89	■□□□□ 0.61
TMEM25-215	ENST00000527267		F5H6K3	240 aa		18.89	■□□□□ 0.61
TMEM25-215	ENST00000527267	ADAMTS4	O75173	837 aa		18.89	■□□□□ 0.61
TMEM25-215	ENST00000527267	SLC4A3	P48751	1232 aa		18.89	■□□□□ 0.61

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