RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 CASZ1Q86V15 1759 aa9.52□□□□□ -0.88
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PDE4D-222ENST00000514552 TIAF1O95411 115 aa9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-222ENST00000514552 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-222ENST00000514552 PWP1Q13610 501 aa9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-222ENST00000514552 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-222ENST00000514552 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.47□□□□□ -0.89
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PDE4D-222ENST00000514552 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 RHOVQ96L33 236 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 MYRFLQ96LU7 910 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.46□□□□□ -0.9
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PDE4D-222ENST00000514552 E9PSI1 815 aa9.45□□□□□ -0.9
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PDE4D-222ENST00000514552 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.45□□□□□ -0.9
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PDE4D-222ENST00000514552 SEPT6Q14141 434 aa9.44□□□□□ -0.9
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PDE4D-222ENST00000514552 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 DYMQ7RTS9 669 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 18.6
PDE4D-222ENST00000514552 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 STK32BQ9NY57 414 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-222ENST00000514552 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.44□□□□□ -0.9
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