RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 MSCO60682 206 aa29.12■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 CYP2C19P33261 490 aa29.11■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 SLC25A27O95847 323 aa29.1■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.1■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 LHX8Q68G74 356 aa29.1■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.1■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.09■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.09■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 ABRAQ8N0Z2 381 aa29.09■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 NAPBQ9H115 298 aa29.09■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa29.09■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 FCER1AP12319 257 aa29.08■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.08■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 IFNL3Q8IZI9 196 aa29.08■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 NYAP2Q9P242 653 aa29.08■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 PFASO15067 1338 aa29.08■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 PRDM1O75626 825 aa29.07■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa29.07■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.07■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 VWA5AO00534 786 aa29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 CYBAP13498 195 aa29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 COPB2P35606 906 aa29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 PDE4BQ07343 736 aa29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 SLF1Q9BQI6 1058 aa29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 MMP19Q99542 508 aa29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 PRO3102Q9H379 93 aa29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 A0A1W2PPC1 479 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 F5H6K3 240 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 COBLO75128 1261 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 NDUFB10O96000 172 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 COL6A1P12109 1028 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 STAT3P40763 770 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 KLRC3Q07444 240 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 KCTD2Q14681 263 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 SALL3Q9BXA9 1300 aa29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 TSPY3P0CV98 308 aa29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 TSPY8P0CW00 308 aa29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 CEP95Q96GE4 821 aa29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 STAP2Q9UGK3 403 aa29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 TTLL1O95922 423 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 PPARAQ07869 468 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 TRPV1Q8NER1 839 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 MAML3Q96JK9 1138 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-211ENST00000514128 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 IGHA2P01877 340 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 SYN1P17600 705 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 EVI5LQ96CN4 794 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 DNM1LO00429 736 aa29■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 SEPT4O43236 478 aa28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 AAMPQ13685 434 aa28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 ARRDC4Q8NCT1 418 aa28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 REPS2Q8NFH8 660 aa28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 KBTBD13C9JR72 458 aa28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 PGK2P07205 417 aa28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 PDE1AP54750 535 aa28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 ZBED4O75132 1171 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 TFAP4Q01664 338 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 MKL1Q969V6 931 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 KIFC2Q96AC6 838 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 ANO1Q5XXA6 986 aa28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 GDF15Q99988 308 aa28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 NRBP1Q9UHY1 535 aa28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 FEM1BQ9UK73 627 aa28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-211ENST00000514128 SLC4A3P48751 1232 aa28.95■■■□□ 2.22
SIMC1-211ENST00000514128 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms