RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 LCTP09848 1927 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPY2A6NKD2 308 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 F5H6K3 240 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ORC4O43929 436 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL1O95922 423 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 FGRP09769 529 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL5P13501 91 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRC3Q07444 240 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MORN1Q5T089 497 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR78Q5VTH9 848 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MCM3APO60318 1980 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 HIP1O00291 1037 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL14Q16627 93 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 USP6NLQ92738 828 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TOMM22Q9NS69 142 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 REPS2Q8NFH8 660 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MYH6P13533 1939 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGCRP04035 888 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 UBXN2AP68543 259 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNA1P78396 465 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PLS1Q14651 629 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MKL1Q969V6 931 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF208Q9H0X6 261 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 STX8Q9UNK0 236 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ERCC3P19447 782 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GRB14Q14449 540 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 APBA2Q99767 749 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD50Q92878 1312 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 VWA5AO00534 786 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMLP26374 656 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 SLFN13Q68D06 897 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 MB21D1Q8N884 522 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPREP23469 700 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS2P41220 211 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP2K5Q13163 448 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 MTMR7Q9Y216 660 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 NOVP48745 357 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 ADORA2AP29274 412 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 PTH1RQ03431 593 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 KIFC2Q96AC6 838 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.132e-7■■■■□ 26.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF213O14771 459 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 GJB1P08034 283 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 BMP3P12645 472 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 MCCP23508 829 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 GJA8P48165 433 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 KCTD1Q719H9 257 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB118Q96PH6 123 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 GMCL1Q96IK5 515 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 RIPK3Q9Y572 518 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 B4E1Z4 1266 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM232C9JQI7 657 aa22.08■■□□□ 1.13
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