RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 MYH4Q9Y623 1939 aa13.01□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 CA12O43570 354 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 FLOT1O75955 427 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 CPA1P15085 419 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 NEK4P51957 841 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ASPRV1Q53RT3 343 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 FAM83BQ5T0W9 1011 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 TREML2Q5T2D2 321 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 SGMS1Q86VZ5 419 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF654Q8IZM8 581 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 FBXL16Q8N461 479 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 CHURC1Q8WUH1 139 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 NUP133Q8WUM0 1156 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 BRF1Q92994 677 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 TCEANC2Q96MN5 208 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 HOXC10Q9NYD6 342 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 FEM1BQ9UK73 627 aa13□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM232C9JQI7 657 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ST18O60284 1047 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 STAT2P52630 851 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 DGKZQ13574 1117 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 MOGSQ13724 837 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 COG2Q14746 738 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GPAT2Q6NUI2 795 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 FAM160B2Q86V87 743 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 FAM43AQ8N2R8 423 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ZIC5Q96T25 663 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 PTPN18Q99952 460 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 LOC285556D6RIA3 1793 aa12.99□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 MYPNQ86TC9 1320 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ZBTB43O43298 467 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 PDHBP11177 359 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GNAQP50148 359 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 RCAN1P53805 252 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 MAP3K14Q99558 947 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 SLF1Q9BQI6 1058 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 SAGE1Q9NXZ1 904 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 THSD7BQ9C0I4 1608 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 PTPRFP10586 1907 aa12.98□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GOLGA8BA8MQT2 603 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 SNHG28P0DPA3 235 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 FDX1P10109 184 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF543Q08ER8 600 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 APOBRQ0VD83 1088 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 PPP2R5BQ15173 497 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 APOA5Q6Q788 366 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 KCTD1Q719H9 257 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 MICU3Q86XE3 530 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 MB21D1Q8N884 522 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 KIFC2Q96AC6 838 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 AGXT2Q9BYV1 514 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GPCPD1Q9NPB8 672 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 RNF186Q9NXI6 227 aa12.97□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GOLGA8AA7E2F4 631 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 PLA2G6O60733 806 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 ZBED4O75132 1171 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 TRPA1O75762 1119 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 CYP2C8P10632 490 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 DSG3P32926 999 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 HERVK_113P62684 666 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 TROAPQ12815 778 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 GRM4Q14833 912 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 SENP2Q9HC62 589 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa12.96□□□□□ -0.33
ITGA3-210ENST00000507771 KLRF2D3W0D1 207 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TLR2O60603 784 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 GOLGA8HP0CJ92 632 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 MCM2P49736 904 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 AK2P54819 239 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CRHR2Q13324 411 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 RTN1Q16799 776 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 SYDE2Q5VT97 1194 aa12.95□□□□□ -0.34
ITGA3-210ENST00000507771 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms