RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496253.1

MFSD9-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 9, human

TSL 2

Gene MFSD9, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	FCER1A	P12319	257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	GNAT2	P19087	354 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	RASA1	P20936	1047 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	PTPRE	P23469	700 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	DSG3	P32926	999 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	GRB14	Q14449	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	KCTD2	Q14681	263 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	COG2	Q14746	738 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	NMT2	O60551	498 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	NDUFB10	O96000	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	CYBA	P13498	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	SNAP25	P60880	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	HAND2	P61296	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	PDE4B	Q07343	736 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	PPARA	Q07869	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	USP6NL	Q92738	828 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253		A0A0D9SFI3	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253		F5H6K3	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	VWA5A	O00534	786 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	COBL	O75128	1261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ZBED4	O75132	1171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TTLL1	O95922	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	STAT3	P40763	770 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC1A4	P43007	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	RTP1	P59025	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	TFAP4	Q01664	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	KLRC3	Q07444	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD9-208	ENST00000496253	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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