RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 CEP290O15078 2479 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 NDUFB10O96000 172 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 CAPN2P17655 700 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 DPF3Q92784 378 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 F5H6K3 240 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 HOXC6P09630 235 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 ADORA2AP29274 412 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 KLRC3Q07444 240 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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PTPRU-207ENST00000492954 TSPY3P0CV98 308 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 TSPY8P0CW00 308 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 TFAP4Q01664 338 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRU-207ENST00000492954 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 INCENPQ9NQS7 918 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
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PTPRU-207ENST00000492954 TTLL1O95922 423 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 DPP9Q86TI2 863 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 MKL1Q969V6 931 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 MROH8Q9H579 483 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 PARP14Q460N5 1801 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRU-207ENST00000492954 ALX1Q15699 326 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 TICAM2Q86XR7 235 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 REPS2Q8NFH8 660 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 COBLO75128 1261 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 SLC25A27O95847 323 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 CYP2C19P33261 490 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRU-207ENST00000492954 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRU-207ENST00000492954 IGHA2P01877 340 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 FGAP02671 866 aa21.39■■□□□ 1.01
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PTPRU-207ENST00000492954 STAT3P40763 770 aa21.39■■□□□ 1.01
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PTPRU-207ENST00000492954 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 TSPY2A6NKD2 308 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 FCER1AP12319 257 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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PTPRU-207ENST00000492954 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 SLFN13Q68D06 897 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRU-207ENST00000492954 TRPV1Q8NER1 839 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRU-207ENST00000492954 MMP19Q99542 508 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 MYH4Q9Y623 1939 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 ORC4O43929 436 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 SLC34A2O95436 690 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 CNGA1P29973 690 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 NBPF3Q9H094 633 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 FEM1BQ9UK73 627 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 EVI5O60447 810 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 FGRP09769 529 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 BMP3P12645 472 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 CYBAP13498 195 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 HAND2P61296 217 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-207ENST00000492954 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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