RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 BTDP43251 543 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 KANK3Q6NY19 840 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 DGKHQ86XP1 1220 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 CYTH3O43739 400 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 RASA1P20936 1047 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 PPP4CP60510 307 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 POLLQ9UGP5 575 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 AFF2P51816 1311 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 GSTO1P78417 241 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 GRM4Q14833 912 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 BLIDQ8IZY5 108 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 DPYDQ12882 1025 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 GGA1Q9UJY5 639 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 BMP15O95972 392 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 LDHCP07864 332 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 DDR1Q08345 913 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 CRY2Q49AN0 593 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TEX11Q8IYF3 940 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ANKS1AQ92625 1134 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 MTRQ99707 1265 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 KCND1Q9NSA2 647 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 OGFRQ9NZT2 677 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 CDK8P49336 464 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 E2F4Q16254 413 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 DACH1Q9UI36 760 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 C6orf229H3BNL8 230 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 RIMBP2O15034 1052 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TEX33O43247 280 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ELF2Q15723 593 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 CERKQ8TCT0 537 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TMX1Q9H3N1 280 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 PP2D1A8MPX8 630 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ATP2B4P23634 1241 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ST5P78524 1137 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 CUL4BQ13620 913 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 KIF18AQ8NI77 898 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 EYA3Q99504 573 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 IL1R1P14778 569 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CALML3P27482 149 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 RHBDL3P58872 404 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SYCP1Q15431 976 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 INF2Q27J81 1249 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TMEM139Q8IV31 216 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PLIN2Q99541 437 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 KLRF2D3W0D1 207 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TRIM37O94972 964 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TRAPPC10P48553 1259 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 IQUBQ8NA54 791 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 F8W031 263 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 M0R2N6 131 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 MYO1BO43795 1136 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 ADRA2BP18089 450 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 HOMER1Q86YM7 354 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms