RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487280.1

WDPCP-215, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 4

Gene WDPCP, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-215ENST00000487280 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.8□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.8□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 DUSP13Q9UII6 198 aa6.8□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 ADAMTS20P59510 1910 aa6.8□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 ATE1O95260 518 aa6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 SYN1P17600 705 aa6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 ZNF394Q53GI3 561 aa6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 SPON2Q9BUD6 331 aa6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 RFXAPO00287 272 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 PGRP06401 933 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 CRKP46108 304 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 SNX17Q15036 470 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 FBXO27Q8NI29 283 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 TMEM87BQ96K49 555 aa6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
WDPCP-215ENST00000487280 TCF3P15923 654 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 NFIXQ14938 502 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 SPATA32Q96LK8 384 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 GCM1Q9NP62 436 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 KCTD3Q9Y597 815 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.77□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 HTR3BO95264 441 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 LTKP29376 864 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 PDE6BP35913 854 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 CHRNEQ04844 493 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 APOBRQ0VD83 1088 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 UBP1Q9NZI7 540 aa6.76□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 E9PSI1 815 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 PLCG1P19174 1290 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 NKD1Q969G9 470 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.75□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 TRIM13O60858 407 aa6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 GJA8P48165 433 aa6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 ZNF165P49910 485 aa6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 DUSP4Q13115 394 aa6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 MLECQ14165 292 aa6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 CXorf38Q8TB03 319 aa6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 SGPP1Q9BX95 441 aa6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 GPR160Q9UJ42 338 aa6.74□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 GRIN3BO60391 1043 aa6.73□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 SEZ6Q53EL9 994 aa6.73□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.73□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.73□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.73□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.73□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 SASH1O94885 1247 aa6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 IMPDH2P12268 514 aa6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 PAK2Q13177 524 aa6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 SSPNQ14714 243 aa6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 FAM13CQ8NE31 585 aa6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 GMIPQ9P107 970 aa6.72□□□□□ -1.33
WDPCP-215ENST00000487280 OR14I1A6ND48 311 aa6.71□□□□□ -1.34
WDPCP-215ENST00000487280 RNF141Q8WVD5 230 aa6.71□□□□□ -1.34
WDPCP-215ENST00000487280 GPRASP2Q96D09 838 aa6.71□□□□□ -1.34
WDPCP-215ENST00000487280 SHISA4Q96DD7 197 aa6.71□□□□□ -1.34
WDPCP-215ENST00000487280 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.71□□□□□ -1.34
WDPCP-215ENST00000487280 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms