RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486268.5

ERGIC3-215, Transcript of ERGIC and golgi 3, human

TSL 2

Gene ERGIC3, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERGIC3-215	ENST00000486268		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRAF5	O00463	557 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PPP6R2	O75170	966 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TTLL1	O95922	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SCG2	P13521	617 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	CALML3	P27482	149 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SHMT1	P34896	483 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	KRT2	P35908	639 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	APLP1	P51693	650 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	SPTLC2	O15270	562 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	MYO1B	O43795	1136 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	SYCE3	A1L190	88 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CTAGE5	O15320	804 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	BMP15	O95972	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	AKR1B1	P15121	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	ME1	P48163	572 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	FSTL1	Q12841	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	MKL1	Q969V6	931 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	RASA3	Q14644	834 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TCP10	Q12799	353 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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