RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 F5H6K3 240 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 SLC34A2O95436 690 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 ADORA2AP29274 412 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 PDE4BQ07343 736 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 KLRC3Q07444 240 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 DPP9Q86TI2 863 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 CEP95Q96GE4 821 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 FAM227BQ96M60 508 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 VWA5AO00534 786 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 STRNO43815 780 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 NDUFB10O96000 172 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 MROH8Q9H579 483 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 INCENPQ9NQS7 918 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 A0A0D9SFI3 127 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 COBLO75128 1261 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 TSPY3P0CV98 308 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 TSPY8P0CW00 308 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 CYP2C19P33261 490 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 TFAP4Q01664 338 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 NUCB1Q02818 461 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 LHX8Q68G74 356 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 MKL1Q969V6 931 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 RILPL2Q969X0 211 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 TTLL1O95922 423 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 REPS2Q8NFH8 660 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-211ENST00000482015 EVI5O60447 810 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 SLC25A27O95847 323 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 IGHA2P01877 340 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 STAT3P40763 770 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 NBPF3Q9H094 633 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 FCER1AP12319 257 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 CNGA1P29973 690 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 TRPV1Q8NER1 839 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 FGAP02671 866 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 ALX1Q15699 326 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 MMP19Q99542 508 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 PARP14Q460N5 1801 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 TSPY2A6NKD2 308 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 NMT2O60551 498 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 SLFN13Q68D06 897 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 TICAM2Q86XR7 235 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 KIFC2Q96AC6 838 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 PGK2P07205 417 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 CYBAP13498 195 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 SDSP20132 328 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 MAML3Q96JK9 1138 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 RIPK3Q9Y572 518 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 PFASO15067 1338 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 BMP3P12645 472 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 SLC4A3P48751 1232 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-211ENST00000482015 KCTD2Q14681 263 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms