RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SDF4Q9BRK5 362 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 NDUFA8P51970 172 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 NR5A1Q13285 461 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 PTPAQ15257 358 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 OGFOD1Q8N543 542 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SPC24Q8NBT2 197 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SMARCA1P28370 1054 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 OXER1Q8TDS5 423 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 A0A1B0GVL5 298 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 KLRF2D3W0D1 207 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 DYNC1I1O14576 645 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 TTLL1O95922 423 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-204ENST00000476231 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 BECN2A8MW95 431 aa21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 NEMFO60524 1076 aa21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 SPDYE6P0CI01 402 aa21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 DNAJC18Q9H819 358 aa21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 MTMR7Q9Y216 660 aa21.83■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 ZNF202O95125 648 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 DLGAP5Q15398 846 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 CALML3P27482 149 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 NLRP5P59047 1200 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 NPY5RQ15761 445 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 DRC7Q8IY82 874 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 CYTH3O43739 400 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 UQCRHP07919 91 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 PTGS1P23219 599 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.81■■□□□ 1.08
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SYF2-204ENST00000476231 CABP5Q9NP86 173 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 HPSEQ9Y251 543 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 PDHBP11177 359 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 CXCL9Q07325 125 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 TNFRSF25Q93038 417 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 SNHG28P0DPA3 235 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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SYF2-204ENST00000476231 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 NFKBIEO00221 500 aa21.79■■□□□ 1.08
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SYF2-204ENST00000476231 PFKFB1P16118 471 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 NLRP12P59046 1061 aa21.79■■□□□ 1.08
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SYF2-204ENST00000476231 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 USP17L5A8MUK1 530 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 PTGER2P43116 358 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 MMP14P50281 582 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 GALNT17Q6IS24 598 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 BARHL2Q9NY43 387 aa21.78■■□□□ 1.08
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