RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 NBPF3Q9H094 633 aa22.12■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.12■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 SZT2Q5T011 3432 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 NAPBQ9H115 298 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 PRO3102Q9H379 93 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 ATP2B2Q01814 1243 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 ICA1Q05084 483 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 LHX8Q68G74 356 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 LAMA4Q16363 1823 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 RASA1P20936 1047 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 PPARAQ07869 468 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 TMX2Q9Y320 296 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 ALPK3Q96L96 1907 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 HIP1O00291 1037 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 SYN1P17600 705 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 DSG3P32926 999 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 GRB14Q14449 540 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 PLS1Q14651 629 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 ALX1Q15699 326 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 CCDC17Q96LX7 622 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-205ENST00000472598 PRDM1O75626 825 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 FLOT1O75955 427 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 FGAP02671 866 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 ERCC3P19447 782 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 CHMLP26374 656 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 CNGA1P29973 690 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 CYP2C19P33261 490 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 DPP9Q86TI2 863 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 ATG4CQ96DT6 458 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 VCPKMTQ9H867 229 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 PFASO15067 1338 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 ZMYM6O95789 1325 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 RAD21O60216 631 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 INCENPQ9NQS7 918 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 HOXC6P09630 235 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 ADORA2AP29274 412 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 TRPV1Q8NER1 839 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 LPAR1Q92633 364 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 COBLO75128 1261 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 SH2D4AQ9H788 454 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 RLFQ13129 1914 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 COL6A1P12109 1028 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 MYH4Q9Y623 1939 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 STRNO43815 780 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 RAD50Q92878 1312 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-205ENST00000472598 PARP14Q460N5 1801 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 FGRP09769 529 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 ANO1Q5XXA6 986 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 MB21D1Q8N884 522 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 GDF15Q99988 308 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 IGHA2P01877 340 aa22■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 HAND2P61296 217 aa22■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 PDE4BQ07343 736 aa22■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 FAM47AQ5JRC9 791 aa22■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 MROH8Q9H579 483 aa22■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 GOPCQ9HD26 462 aa22■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 SGSM2O43147 1006 aa21.99■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.99■■□□□ 1.11
SYP-205ENST00000472598 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms