RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464957.1

CPTP-202, Transcript of ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

TSL 2

Gene CPTP, Length 1,101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTP-202ENST00000464957 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa36.41■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 TMEM132BQ14DG7 1078 aa36.4■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 GOPCQ9HD26 462 aa36.4■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 MYH7P12883 1935 aa36.4■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa36.39■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 CTR9Q6PD62 1173 aa36.39■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 MAML3Q96JK9 1138 aa36.39■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 RCAN3Q9UKA8 241 aa36.39■■■■□ 3.42
CPTP-202ENST00000464957 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa36.37■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 MMP19Q99542 508 aa36.37■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 MTMR10Q9NXD2 777 aa36.37■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 DLL1O00548 723 aa36.36■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 FBXO28Q9NVF7 368 aa36.36■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa36.35■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 PARP14Q460N5 1801 aa36.35■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa36.34■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 STAT3P40763 770 aa36.33■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 KCTD2Q14681 263 aa36.33■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 FAM83BQ5T0W9 1011 aa36.33■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 RIOX2Q8IUF8 465 aa36.33■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 ECHDC1Q9NTX5 307 aa36.33■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa36.33■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.41
CPTP-202ENST00000464957 VWA5AO00534 786 aa36.32■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 LRRC41Q15345 812 aa36.32■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 PGK2P07205 417 aa36.31■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 COPB2P35606 906 aa36.31■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 ADCYAP1R1P41586 468 aa36.31■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 FAM47AQ5JRC9 791 aa36.31■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 STK11IPQ8N1F8 1099 aa36.31■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 MKNK2Q9HBH9 465 aa36.31■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 TRIM60Q495X7 471 aa36.3■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 FERMT2Q96AC1 680 aa36.3■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 NRBP1Q9UHY1 535 aa36.3■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 RARBP10826 455 aa36.29■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 C20orf194Q5TEA3 1177 aa36.29■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 GPATCH3Q96I76 525 aa36.29■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa36.29■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 DNAH12Q6ZR08 3092 aa36.28■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 SBK1Q52WX2 424 aa36.28■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 TINF2Q9BSI4 451 aa36.28■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 MINDY4BA8MYZ0 360 aa36.27■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 COL6A3P12111 3177 aa36.27■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 LTBP2Q14767 1821 aa36.27■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 SNX17Q15036 470 aa36.26■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 ZNF792Q3KQV3 632 aa36.26■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 KBTBD3Q8NAB2 608 aa36.26■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.4
CPTP-202ENST00000464957 GSG1L2A8MUP6 293 aa36.25■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 RASA1P20936 1047 aa36.25■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 GIMAP6Q6P9H5 292 aa36.25■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 RNF180Q86T96 592 aa36.25■■■■□ 3.39
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CPTP-202ENST00000464957 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 SLF1Q9BQI6 1058 aa36.25■■■■□ 3.39
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CPTP-202ENST00000464957 NYAP2Q9P242 653 aa36.24■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa36.23■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 BADQ92934 168 aa36.23■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 OSBP2Q969R2 916 aa36.23■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 PDLIM7Q9NR12 457 aa36.23■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 CNPY2Q9Y2B0 182 aa36.23■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 F5H6K3 240 aa36.22■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 POTEB2H3BUK9 544 aa36.22■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 KLRC3Q07444 240 aa36.22■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 C1orf53Q5VUE5 145 aa36.22■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 FAM161BQ96MY7 647 aa36.22■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 TEX13BQ9BXU2 312 aa36.22■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 PHF24Q9UPV7 400 aa36.22■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 PGK1P00558 417 aa36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 APPP05067 770 aa36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 AKR1A1P14550 325 aa36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 SLC4A3P48751 1232 aa36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 TDO2P48775 406 aa36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 DDX11Q96FC9 970 aa36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 ZNF287Q9HBT7 754 aa36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 CLIP2Q9UDT6 1046 aa36.21■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 ROBO3Q96MS0 1386 aa36.2■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 NDUFB10O96000 172 aa36.2■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 GNAT2P19087 354 aa36.2■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 SHHQ15465 462 aa36.2■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 ZNF697Q5TEC3 545 aa36.2■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 TSHZ3Q63HK5 1081 aa36.2■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
CPTP-202ENST00000464957 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
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