RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448992.5

RHBDD1-209, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-209ENST00000448992 CTR9Q6PD62 1173 aa18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 MMP19Q99542 508 aa18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 RLFQ13129 1914 aa18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 RTP1P59025 263 aa18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 ANO1Q5XXA6 986 aa18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 MAML3Q96JK9 1138 aa18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 IGHA2P01877 340 aa18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 CHGBP05060 677 aa18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1-209ENST00000448992 PARP14Q460N5 1801 aa18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 VWA5AO00534 786 aa18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 STAT3P40763 770 aa18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 SMIM22K7EJ46 135 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 RARBP10826 455 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 Q7L0L9 218 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 PGK2P07205 417 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 GNAT2P19087 354 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 TDO2P48775 406 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 SBK1Q52WX2 424 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 APPBP2Q92624 585 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 APPP05067 770 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ADCYAP1R1P41586 468 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 LRRC41Q15345 812 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 TRIM60Q495X7 471 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 RNF180Q86T96 592 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 TINF2Q9BSI4 451 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 TEX13BQ9BXU2 312 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 CNPY2Q9Y2B0 182 aa18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 RASA1P20936 1047 aa18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 FERMT2Q96AC1 680 aa18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 MTMR10Q9NXD2 777 aa18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 NYAP2Q9P242 653 aa18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 DLL1O00548 723 aa18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 GPAA1O43292 621 aa18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 AKR1A1P14550 325 aa18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 SLC4A3P48751 1232 aa18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF792Q3KQV3 632 aa18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 DDX11Q96FC9 970 aa18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 DCTPP1Q9H773 170 aa18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 F5H6K3 240 aa18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ZBED4O75132 1171 aa18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 KLRC3Q07444 240 aa18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 SNX17Q15036 470 aa18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 OSBP2Q969R2 916 aa18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 PHF24Q9UPV7 400 aa18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1-209ENST00000448992 LTBP2Q14767 1821 aa18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 ERC2O15083 957 aa18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 NDUFB10O96000 172 aa18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF697Q5TEC3 545 aa18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 CPXCR1Q8N123 301 aa18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 REPS2Q8NFH8 660 aa18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms