RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 STAP2Q9UGK3 403 aa22.39■■□□□ 1.17
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CCDC78-204ENST00000439619 F5H6K3 240 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 PDE1AP54750 535 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 KLRC3Q07444 240 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 TICAM2Q86XR7 235 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 PLXNB2O15031 1838 aa22.37■■□□□ 1.17
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CCDC78-204ENST00000439619 PPARAQ07869 468 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.37■■□□□ 1.17
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CCDC78-204ENST00000439619 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 MYH8P13535 1937 aa22.37■■□□□ 1.17
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CCDC78-204ENST00000439619 TTLL1O95922 423 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 STAT3P40763 770 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 KCTD2Q14681 263 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.36■■□□□ 1.17
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CCDC78-204ENST00000439619 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 CYP2C19P33261 490 aa22.35■■□□□ 1.17
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CCDC78-204ENST00000439619 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 ZBED4O75132 1171 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 NDUFB10O96000 172 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 LHX8Q68G74 356 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 MKL1Q969V6 931 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 CEP95Q96GE4 821 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 MMP19Q99542 508 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 LNPKQ9C0E8 428 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 TFAP4Q01664 338 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 TSPY2A6NKD2 308 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.32■■□□□ 1.16
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CCDC78-204ENST00000439619 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.32■■□□□ 1.16
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CCDC78-204ENST00000439619 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.31■■□□□ 1.16
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CCDC78-204ENST00000439619 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.31■■□□□ 1.16
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CCDC78-204ENST00000439619 FDX1P10109 184 aa22.3■■□□□ 1.16
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CCDC78-204ENST00000439619 RILPL2Q969X0 211 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 KIFC2Q96AC6 838 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 MAML3Q96JK9 1138 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.3■■□□□ 1.16
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CCDC78-204ENST00000439619 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.29■■□□□ 1.16
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CCDC78-204ENST00000439619 COL6A1P12109 1028 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 BMP3P12645 472 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 SLFN13Q68D06 897 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 DDX11Q96FC9 970 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 STX8Q9UNK0 236 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1W2PPC1 479 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 DNM1LO00429 736 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 ATP2A1O14983 1001 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 SLC4A3P48751 1232 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 ALX1Q15699 326 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 CPXCR1Q8N123 301 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 REPS2Q8NFH8 660 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 TOMM22Q9NS69 142 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-204ENST00000439619 FBXO40Q9UH90 709 aa22.28■■□□□ 1.16
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