RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

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Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
LIN28AP1-201ENST00000429574 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
LIN28AP1-201ENST00000429574 NYAP2Q9P242 653 aa22.46■■□□□ 1.19
LIN28AP1-201ENST00000429574 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
LIN28AP1-201ENST00000429574 PRDM1O75626 825 aa22.45■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 COPB2P35606 906 aa22.45■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.45■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.45■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.45■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.45■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.45■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 F5H6K3 240 aa22.44■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 CYP2C19P33261 490 aa22.44■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 KLRC3Q07444 240 aa22.44■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.44■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.44■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 MMP19Q99542 508 aa22.44■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.44■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 STAT3P40763 770 aa22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 KCTD2Q14681 263 aa22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 RLFQ13129 1914 aa22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYH4Q9Y623 1939 aa22.43■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.42■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 VWA5AO00534 786 aa22.42■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 TTLL1O95922 423 aa22.42■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC4A3P48751 1232 aa22.42■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPARAQ07869 468 aa22.42■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZBED4O75132 1171 aa22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDE1AP54750 535 aa22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 TFAP4Q01664 338 aa22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 LHX8Q68G74 356 aa22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 CEP290O15078 2479 aa22.41■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 NDUFB10O96000 172 aa22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 CEP95Q96GE4 821 aa22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 STAP2Q9UGK3 403 aa22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 PARP14Q460N5 1801 aa22.4■■□□□ 1.18
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 TSPY2A6NKD2 308 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 COBLO75128 1261 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIFC2Q96AC6 838 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 LNPKQ9C0E8 428 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 FEM1BQ9UK73 627 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.39■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 CPXCR1Q8N123 301 aa22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 MKL1Q969V6 931 aa22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 RILPL2Q969X0 211 aa22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 DDX11Q96FC9 970 aa22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 MAML3Q96JK9 1138 aa22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 TOMM22Q9NS69 142 aa22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 KBTBD13C9JR72 458 aa22.37■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 CYBAP13498 195 aa22.37■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLFN13Q68D06 897 aa22.37■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 STX8Q9UNK0 236 aa22.37■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 ALPK3Q96L96 1907 aa22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 SEPT4O43236 478 aa22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 PGK2P07205 417 aa22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 BMP3P12645 472 aa22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 DNM1LO00429 736 aa22.35■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 SYN1P17600 705 aa22.35■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.35■■□□□ 1.17
LIN28AP1-201ENST00000429574 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.35■■□□□ 1.17
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