RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBXN4-204ENST00000426921 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.9■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.9■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 SLC25A27O95847 323 aa24.9■■□□□ 1.58
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UBXN4-204ENST00000426921 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.8■■□□□ 1.56
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UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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UBXN4-204ENST00000426921 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.79■■□□□ 1.56
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UBXN4-204ENST00000426921 TSPY3P0CV98 308 aa24.78■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 TSPY8P0CW00 308 aa24.78■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 TINF2Q9BSI4 451 aa24.78■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.77■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.77■■□□□ 1.56
UBXN4-204ENST00000426921 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.77■■□□□ 1.56
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