RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB11FIP3O75154 756 aa15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCER1AP12319 257 aa15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC17Q96LX7 622 aa15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUCD1Q96NT3 240 aa15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM22K7EJ46 135 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A27O95847 323 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK8P49336 464 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC41Q15345 812 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM60Q495X7 471 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf60Q5U649 245 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5JP18859 108 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM161BQ96MY7 647 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAUS7Q99871 368 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDLIM7Q9NR12 457 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa15.85■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP17L12C9JPN9 530 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP17L21D6R901 530 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHGBP05060 677 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCYAP1R1P41586 468 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE3CQ15386 1083 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP19Q99542 508 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COG6Q9Y2V7 657 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH23Q9H251 3354 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHHQ15465 462 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BADQ92934 168 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FERMT2Q96AC1 680 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOPCQ9HD26 462 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.84■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EYSQ5T1H1 3165 aa15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGK2P07205 417 aa15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RARBP10826 455 aa15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD2Q14681 263 aa15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIER1Q8N108 512 aa15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TINF2Q9BSI4 451 aa15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF24Q9UPV7 400 aa15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.83■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VWA5AO00534 786 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPB2P35606 906 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAT3P40763 770 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF792Q3KQV3 632 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTR9Q6PD62 1173 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REPS2Q8NFH8 660 aa15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD21O60216 631 aa15.81■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLE2Q04725 743 aa15.81■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF180Q86T96 592 aa15.81■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGK1P00558 417 aa15.8■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKR1A1P14550 325 aa15.8■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VCANP13611 3396 aa15.8■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQY0 241 aa15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLTBP09497 229 aa15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.79■□□□□ 0.12
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYH4Q9Y623 1939 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms