RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 SPECC1Q5M775 1068 aa23.01■■□□□ 1.27
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SUMO3-204ENST00000411651 KLRF2D3W0D1 207 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 STXBP3O00186 592 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 SMC2O95347 1197 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 RXRBP28702 533 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 MORC3Q14149 939 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 TEKT1Q969V4 418 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 LAD1O00515 517 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 WWC2Q6AWC2 1192 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 CEP95Q96GE4 821 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 EHD4Q9H223 541 aa23■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23■■□□□ 1.27
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SUMO3-204ENST00000411651 ZNF174Q15697 407 aa22.99■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.99■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 ESYT2A0FGR8 921 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 CBFA2T2O43439 604 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 H0YIN7 160 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 WNT7AO00755 349 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 SNHG28P0DPA3 235 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 FBXW7Q969H0 707 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.98■■□□□ 1.27
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SUMO3-204ENST00000411651 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 G3V3G9 751 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 USP49Q70CQ1 688 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 CNKSR1Q969H4 720 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 GSDMAQ96QA5 445 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 MYH8P13535 1937 aa22.97■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 GNA11P29992 359 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 USP40Q9NVE5 1235 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 FOXN1O15353 648 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 HLA-DOAP06340 250 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 BMP6P22004 513 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 PRPHP41219 470 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 IQUBQ8NA54 791 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 EPSTI1Q96J88 318 aa22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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SUMO3-204ENST00000411651 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 KCND1Q9NSA2 647 aa22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 A0A087X0B3 334 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.94■■□□□ 1.26
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SUMO3-204ENST00000411651 E2F4Q16254 413 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 DOK7Q18PE1 504 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 DHX58Q96C10 678 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 PAGE5Q96GU1 130 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC17Q96LX7 622 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 C6orf50Q9HD87 102 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 IFNKQ9P0W0 207 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 TTLL1O95922 423 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 TXLNAP40222 546 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 SEMA3FQ13275 785 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 PICALMQ13492 652 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 PDILTQ8N807 584 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 MCM7P33993 719 aa22.93■■□□□ 1.26
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