RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 VCANP13611 3396 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SEPT4O43236 478 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SNX17Q15036 470 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 FAM47AQ5JRC9 791 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 MB21D1Q8N884 522 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 MYH7P12883 1935 aa16.01■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 GSG1L2A8MUP6 293 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 POTEB2H3BUK9 544 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 MSCO60682 206 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 RASA1P20936 1047 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ITGB8P26012 769 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC41Q15345 812 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ABRAQ8N0Z2 381 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 OSBP2Q969R2 916 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC17Q96LX7 622 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 GUCD1Q96NT3 240 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 MROH8Q9H579 483 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 VWA5AO00534 786 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 MS4A1P11836 297 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF792Q3KQV3 632 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM60Q495X7 471 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 DLL1O00548 723 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ADCYAP1R1P41586 468 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 FERMT2Q96AC1 680 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 PDLIM7Q9NR12 457 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 RIPK3Q9Y572 518 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 FCER1AP12319 257 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 MMP19Q99542 508 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 M0R2C6 588 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 PGK1P00558 417 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 STAT3P40763 770 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SHHQ15465 462 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SBK1Q52WX2 424 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 BADQ92934 168 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 TINF2Q9BSI4 451 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 SH2D4AQ9H788 454 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-202ENST00000393503 KBTBD13C9JR72 458 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 ADCY6O43306 1168 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 SLC25A27O95847 323 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 NDUFB10O96000 172 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 EPHB4P54760 987 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 FGD4Q96M96 766 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 FAM161BQ96MY7 647 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 PHF24Q9UPV7 400 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTS4O75173 837 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 PRDM1O75626 825 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 TLE2Q04725 743 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 DCTPP1Q9H773 170 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 GOPCQ9HD26 462 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 MYADML2A6NDP7 307 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 F5H6K3 240 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 FOXP2O15409 715 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 GPAA1O43292 621 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 RAD21O60216 631 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 KLRC3Q07444 240 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms