RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 FAM83BQ5T0W9 1011 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 SHCBP1Q8NEM2 672 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF236Q9UL36 1845 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 SLC34A2O95436 690 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 HOXC6P09630 235 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 PPARAQ07869 468 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 ANKLE1Q8NAG6 615 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 CEP95Q96GE4 821 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 ALPK3Q96L96 1907 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 F5H6K3 240 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 KLRC3Q07444 240 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 VPS53Q5VIR6 699 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 NCAPG2Q86XI2 1143 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 MROH8Q9H579 483 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 OGDHLQ9ULD0 1010 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 STRNO43815 780 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 NDUFB10O96000 172 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 ADORA2AP29274 412 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 PDE4BQ07343 736 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 MFSD14CQ5VZR4 134 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 FAM227BQ96M60 508 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 NECAB2Q7Z6G3 386 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 DPP9Q86TI2 863 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 MKL1Q969V6 931 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 FRMPD3Q5JV73 1810 aa27.95■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 A0A0D9SFI3 127 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 VWA5AO00534 786 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 TFAP4Q01664 338 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 LHX8Q68G74 356 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 REPS2Q8NFH8 660 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 COBLO75128 1261 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 IGHA2P01877 340 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 TSPY3P0CV98 308 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 TSPY8P0CW00 308 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 CYP2C19P33261 490 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 CTDSPL2Q05D32 466 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 INCENPQ9NQS7 918 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.061e-7■■□□□ 11.9
FAAP20-201ENST00000378543 SLC25A27O95847 323 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 TTLL1O95922 423 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 RILPL2Q969X0 211 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 SLF1Q9BQI6 1058 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 STAT3P40763 770 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 RIOX2Q8IUF8 465 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 NBPF3Q9H094 633 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 ALX1Q15699 326 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 TRPV1Q8NER1 839 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 ANAPC4Q9UJX5 808 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 NR2E3Q9Y5X4 410 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 EVI5O60447 810 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 FCER1AP12319 257 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 OLFML2BQ68BL8 750 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 C11orf49Q9H6J7 331 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 CNGA1P29973 690 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 MMP19Q99542 508 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-201ENST00000378543 FGAP02671 866 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 CYBAP13498 195 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 SLFN13Q68D06 897 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 TSPY2A6NKD2 308 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 HIP1O00291 1037 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 SDSP20132 328 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 CHRDL2Q6WN34 429 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 KIFC2Q96AC6 838 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-201ENST00000378543 MAML3Q96JK9 1138 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms