RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 DPF2Q92785 391 aa17.71■□□□□ 0.43
CASQ1-201ENST00000368078 CABP5Q9NP86 173 aa17.71■□□□□ 0.43
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA7Q9UN72 937 aa17.71■□□□□ 0.43
CASQ1-201ENST00000368078 RAD21O60216 631 aa17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SNHG28P0DPA3 235 aa17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ME1P48163 572 aa17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 NASPP49321 788 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 LZTS2Q9BRK4 669 aa17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 POLR3EQ9NVU0 708 aa17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 LMNB1P20700 586 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 KRT2P35908 639 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 NLRP5P59047 1200 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RASA3Q14644 834 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD1Q719H9 257 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FAM83AQ86UY5 434 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HOMER1Q86YM7 354 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 MKL1Q969V6 931 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PIGSQ96S52 555 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FSD2A1L4K1 749 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ATP2B1P20020 1258 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 WWC2Q6AWC2 1192 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 BICD2Q8TD16 824 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SPZ1Q9BXG8 430 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 NYAP2Q9P242 653 aa17.69■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SPTLC2O15270 562 aa17.68■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SLC16A2P36021 539 aa17.68■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF445P59923 1031 aa17.68■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ICA1Q05084 483 aa17.68■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PTPAQ15257 358 aa17.68■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.68■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HACL1Q9UJ83 578 aa17.68■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 NR1I2O75469 434 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF543Q08ER8 600 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SLC39A14Q15043 492 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PRG0 241 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 YEATS4O95619 227 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ASPRV1Q53RT3 343 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC183Q5T5S1 534 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SLFN13Q68D06 897 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TNFRSF25Q93038 417 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TEPSINQ96N21 525 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 DACT1Q9NYF0 836 aa17.67■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 STXBP3O00186 592 aa17.66■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 WNT7AO00755 349 aa17.66■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CAMK4Q16566 473 aa17.66■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC96Q2M329 555 aa17.66■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RASGRP4Q8TDF6 673 aa17.66■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 JMJD4Q9H9V9 463 aa17.66■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D12O60347 775 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SMARCA1P28370 1054 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 EPS15P42566 896 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ECE1P42892 770 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 MMP14P50281 582 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ADALQ6DHV7 355 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRF4Q8IZF3 695 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TRPM4Q8TD43 1214 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 BARHL2Q9NY43 387 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 F5H6K3 240 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 H7C1D1 291 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TNNI2P48788 182 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 KLRC3Q07444 240 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 BLIDQ8IZY5 108 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 KCNG4Q8TDN1 519 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ACER1Q8TDN7 264 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 MRVI1Q9Y6F6 885 aa17.65■□□□□ 0.42
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GVL5 298 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L10C9JJH3 530 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 DDNO94850 711 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 MAP3K10Q02779 954 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 RILPL1Q5EBL4 403 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 LRSAM1Q6UWE0 723 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GPC2Q8N158 579 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FSIP1Q8NA03 581 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 COA7Q96BR5 231 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CLIC6Q96NY7 704 aa17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms