RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 MYL5Q02045 173 aa26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 DHX58Q96C10 678 aa26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 SMC2O95347 1197 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 MCM7P33993 719 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 ARID5BQ14865 1188 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.09■■□□□ 1.77
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SNX18-201ENST00000326277 SMARCE1Q969G3 411 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 M0R2N6 131 aa26.08■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 SCNN1DP51172 638 aa26.08■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.08■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 CPVLQ9H3G5 476 aa26.08■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 BARHL2Q9NY43 387 aa26.08■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 G3V3G9 751 aa26.08■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 STXBP3O00186 592 aa26.08■■□□□ 1.77
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SNX18-201ENST00000326277 NOVP48745 357 aa26.08■■□□□ 1.77
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SNX18-201ENST00000326277 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.08■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 ATP1A3P13637 1013 aa26.07■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.07■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.07■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 USP40Q9NVE5 1235 aa26.07■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 TPM2P07951 284 aa26.07■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 SLFN14P0C7P3 912 aa26.07■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 SPATA20Q8TB22 786 aa26.07■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 IL17AQ16552 155 aa26.06■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.06■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.06■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.05■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 GALNT17Q6IS24 598 aa26.05■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.05■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.05■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.04■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.04■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 PAGE5Q96GU1 130 aa26.04■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.04■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.04■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 AFMP43652 599 aa26.03■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 TEKT1Q969V4 418 aa26.03■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 USP17L5A8MUK1 530 aa26.03■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 HOMER1Q86YM7 354 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX18-201ENST00000326277 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.76
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SNX18-201ENST00000326277 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.01■■□□□ 1.75
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SNX18-201ENST00000326277 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 CASP1P29466 404 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 NAPAP54920 295 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 INF2Q27J81 1249 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 STYK1Q6J9G0 422 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 VAT1LQ9HCJ6 419 aa26■■□□□ 1.75
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SNX18-201ENST00000326277 SERPINC1P01008 464 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 PDHBP11177 359 aa26■■□□□ 1.75
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SNX18-201ENST00000326277 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 E2F4Q16254 413 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 DPF2Q92785 391 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 SWAP70Q9UH65 585 aa26■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 CRKP46108 304 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 UBASH3AP57075 661 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 DPYDQ12882 1025 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNX18-201ENST00000326277 PIGSQ96S52 555 aa25.99■■□□□ 1.75
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