RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 MCM7P33993 719 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 TSPY3P0CV98 308 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 TSPY8P0CW00 308 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 CBX1P83916 185 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 SPAG1Q07617 926 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 SEMA3FQ13275 785 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 CNBD1Q8NA66 436 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 JAG2Q9Y219 1238 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 ELF2Q15723 593 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 LAD1O00515 517 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 PBX1P40424 430 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 IL17AQ16552 155 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-201ENST00000311008 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 M0R2N6 131 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 MYL1P05976 194 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 ADRA2BP18089 450 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 STX17P56962 302 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 PTPN21Q16825 1174 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC51Q96ER9 411 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 PLCG2P16885 1265 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 CASP1P29466 404 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 NFIXQ14938 502 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 TPM1P09493 284 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 BARHL2Q9NY43 387 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 PAK1Q13153 545 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 CNGA4Q8IV77 575 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.132e-6■■□□□ 12.2
SPNS1-201ENST00000311008 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 LY75O60449 1722 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 SBF2Q86WG5 1849 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 TEX33O43247 280 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC175P0C221 793 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 ATP2B4P23634 1241 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 CASQ1P31415 396 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 PRPHP41219 470 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 STAT6P42226 847 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 SLF2Q8IX21 1173 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L3A6NCW0 530 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L4A6NCW7 530 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 MNS1Q8NEH6 495 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 CERKQ8TCT0 537 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 DISC1Q9NRI5 854 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.11■■□□□ 1.13
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