RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Muc1Q02496 630 aa13.17□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ece1Q4PZA2 769 aa13.17□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fbxo28Q8BIG4 368 aa13.17□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ift74Q8BKE9 600 aa13.17□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pold4Q9CWP8 107 aa13.17□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lman2lP59481 347 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ZyxQ62523 564 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zbtb7bQ64321 544 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdc14aQ6GQT0 603 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 BcrQ6PAJ1 1270 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Usp17leQ7M764 540 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kdm8Q9CXT6 414 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plxnb3Q9QY40 1902 aa13.16□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa13.15□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Supt3B0QZW4 406 aa13.15□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa13.15□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Golim4Q8BXA1 655 aa13.15□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Iws1Q8C1D8 766 aa13.15□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdk8Q8R3L8 464 aa13.15□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SerhlQ9EPB5 311 aa13.15□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Galk1Q9R0N0 392 aa13.15□□□□□ -0.3
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmem240B2RWJ3 173 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trim12cD3Z3L3 497 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ankrd35E9Q9D8 996 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Entpd7Q3TCT4 606 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmed8Q3UHI4 326 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Onecut3Q8K557 490 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atg13Q91YI1 516 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CutaQ9CQ89 177 aa13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Inpp5jP59644 1003 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Stim2P83093 746 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Srebf2Q3U1N2 1130 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Il17raQ60943 864 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc9a7Q8BLV3 726 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf687Q9D2D7 1237 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sept3Q9Z1S5 350 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mmp8O70138 465 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Defa-rs2P17534 91 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rasip1Q3U0S6 961 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Limch1Q3UH68 1057 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Skap1Q3UUV5 355 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prmt6Q6NZB1 378 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zbtb39Q6PDK0 712 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Senp7Q8BUH8 1037 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MlphQ91V27 590 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Spred2Q924S7 410 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cep72Q9D3R3 646 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pus10Q9D3U0 527 aa13.13□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lamb2Q61292 1799 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 BC025446A0A087WQT1 134 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1700006A11RikB9EHI3 544 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trdmt1O55055 415 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Aldh1a1P24549 501 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rbp3P49194 1234 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ScapQ6GQT6 1276 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vps53Q8CCB4 832 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fez1Q8K0X8 392 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Stard7Q8R1R3 373 aa13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ltbp2O08999 1813 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Capn2O08529 700 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf800Q0VEE6 662 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf667Q2TL60 609 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tshz1Q5DTH5 1084 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PtprcapQ64697 197 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ddx11Q6AXC6 880 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Phf24Q80TL4 400 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gga3Q8BMI3 718 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PdgfcQ8CI19 345 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 DnerQ8JZM4 737 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rab30Q923S9 203 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kank3Q9Z1P7 791 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdh23Q99PF4 3354 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mia3Q8BI84 1930 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 A0A1W2P6Q8 802 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 A0A1W2P7Z8 802 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm9046A0A1W2P855 802 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pbx2O35984 430 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cln3Q61124 438 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 HelbQ6NVF4 1074 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Usp6nlQ80XC3 819 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.8 ms