RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	FRT2	P39734	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ALG5	P40350	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PFD1	P46988	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TAH11	P47112	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AZR1	P50080	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SCS3	P53012	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MIG2	P53035	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	BIO4	P53630	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YNR063W	P53749	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MET14	Q02196	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MUB1	Q03162	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AIM32	Q04689	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YET3	Q07451	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PEX15	Q08215	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TPK1	P06244	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
BUD22	YMR014W	CDC20	P26309	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SIN4	P32259	974 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ERP5	P38819	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	JEM1	P40358	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YIL001W	P40560	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AXL1	P40851	1208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SKP2	P42843	763 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	POL31	P46957	487 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	BFA1	P47113	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SPT20	P50875	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SKY1	Q03656	742 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HFD1	Q04458	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	BUD14	P27637	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	NDI1	P32340	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RDH54	P38086	958 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AGP2	P38090	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	BIT2	P38346	545 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YHL026C	P38740	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HSE1	P38753	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TAT2	P38967	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
BUD22	YMR014W	ESL1	P40456	1118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	FAR3	P46671	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YJR107W	P47145	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SLG1	P54867	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	STP1	Q00947	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MUK1	Q02866	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TVP15	Q03860	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	CDD1	Q06549	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	NBP2	Q12163	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RGS2	Q99188	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	INO1	P11986	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PHA2	P32452	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TFC3	P34111	1160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RIM2	P38127	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	CTP1	P38152	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YJL206C	P39529	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PEP8	P40335	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ALY2	P47029	1046 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MRX6	P48564	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	GCV2	P49095	1034 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TEL2	P53038	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MRM2	P53123	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	UBX4	P54730	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	CDC123	Q05791	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RSC58	Q07979	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	OSW1	Q08692	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HRT3	Q12347	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HAP2	P06774	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SPS1	P08458	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	REC107	P21651	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MRPS28	P21771	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	CYM1	P32898	989 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TKL2	P33315	681 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SLA2	P33338	968 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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