RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639849.1

EPM2A-222, Transcript of EPM2A, laforin glucan phosphatase, human

TSL 3

Gene EPM2A, Length 804 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPM2A-222	ENST00000639849	ABCC1	P33527	1531 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	TACR2	P21452	398 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	LILRA2	Q8N149	483 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	MFSD4A	Q8N468	514 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	RNF214	Q8ND24	703 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	ZNF576	Q9H609	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	KRT82	Q9NSB4	513 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	PLA2R1	Q13018	1463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	PDGFA	P04085	211 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849		Q8N1X5	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	TTC16	Q8NEE8	873 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	CPS1	P31327	1500 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	PDE6B	P35913	854 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	EPHB3	P54753	998 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	PTPRK	Q15262	1439 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPM2A-222	ENST00000639849	ATP7A	Q04656	1500 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	A2M	P01023	1474 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ESR1	P03372	595 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	HSPA1L	P34931	641 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ERVK-24	P63145	666 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	VWCE	Q96DN2	955 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	CPZ	Q66K79	652 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	N4BP3	O15049	544 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	FGD1	P98174	961 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	UBXN11	Q5T124	520 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		5	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ITPKA	P23677	461 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	NTF4	P34130	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	NR0B2	Q15466	257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	TNR	Q92752	1358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	HRK	O00198	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	KIF3B	O15066	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	OXR1	Q8N573	874 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61

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