RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 APBA2Q99767 749 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HAUS7Q99871 368 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NBPF3Q9H094 633 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STAP2Q9UGK3 403 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP17L12C9JPN9 530 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP17L21D6R901 530 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDK8P49336 464 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRB14Q14449 540 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UBE3CQ15386 1083 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C12orf60Q5U649 245 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SWAP70Q9UH65 585 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMX2Q9Y320 296 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HOXC6P09630 235 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COL6A1P12109 1028 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNGA1P29973 690 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYP2C19P33261 490 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ICA1Q05084 483 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COG2Q14746 738 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CTR9Q6PD62 1173 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATG4CQ96DT6 458 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRCH3Q96II8 777 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC17Q96LX7 622 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GDF15Q99988 308 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VCPKMTQ9H867 229 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SZT2Q5T011 3432 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A1W2PPC1 479 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COBLO75128 1261 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FLOT1O75955 427 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IGHA2P01877 340 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERCC3P19447 782 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADORA2AP29274 412 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DSG3P32926 999 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BMP8BP34820 402 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATP2B2Q01814 1243 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLS1Q14651 629 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRRC26Q2I0M4 334 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DPP9Q86TI2 863 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRPV1Q8NER1 839 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LPAR1Q92633 364 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCTPP1Q9H773 170 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SH2D4AQ9H788 454 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYH4Q9Y623 1939 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STRNO43815 780 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYBAP13498 195 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANO1Q5XXA6 986 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MB21D1Q8N884 522 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OSBP2Q969R2 916 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LTBP2Q14767 1821 aa7.1□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.09□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.09□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 M0R2C6 588 aa7.09□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GPAA1O43292 621 aa7.09□□□□□ -1.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RAD21O60216 631 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms