RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 HOXC6P09630 235 aa22.2■■□□□ 1.14
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CLN3-241ENST00000635861 COG2Q14746 738 aa22.2■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.2■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 GRB14Q14449 540 aa22.19■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 MB21D1Q8N884 522 aa22.19■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 BTBD7Q9P203 1132 aa22.19■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.19■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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CLN3-241ENST00000635861 C12orf60Q5U649 245 aa22.18■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.18■■□□□ 1.14
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CLN3-241ENST00000635861 MSCO60682 206 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 CCL14Q16627 93 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 TMX2Q9Y320 296 aa22.17■■□□□ 1.14
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CLN3-241ENST00000635861 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.16■■□□□ 1.14
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CLN3-241ENST00000635861 ICA1Q05084 483 aa22.15■■□□□ 1.14
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CLN3-241ENST00000635861 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.15■■□□□ 1.14
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CLN3-241ENST00000635861 USP17L21D6R901 530 aa22.14■■□□□ 1.13
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CLN3-241ENST00000635861 ATP2B2Q01814 1243 aa22.14■■□□□ 1.13
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CLN3-241ENST00000635861 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 ATG4CQ96DT6 458 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 DNM1LO00429 736 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 CNGA1P29973 690 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 CYP2C19P33261 490 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 COPB2P35606 906 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN3-241ENST00000635861 PLS1Q14651 629 aa22.06■■□□□ 1.12
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