RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 GABPAQ06546 454 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 GRB14Q14449 540 aa29.04■■■□□ 2.24
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CAPNS1-216ENST00000628306 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 FEZ1Q99689 392 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 USP14P54578 494 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CERS3Q8IU89 383 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RLFQ13129 1914 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNA1P78396 465 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
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CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JMZ2 1700 aa29■■■□□ 2.23
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CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2C19P33261 490 aa29■■■□□ 2.23
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CAPNS1-216ENST00000628306 PDE6AP16499 860 aa28.94■■■□□ 2.22
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CAPNS1-216ENST00000628306 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.89■■■□□ 2.22
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CAPNS1-216ENST00000628306 DSG3P32926 999 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 DPP9Q86TI2 863 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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