RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	GNAQ	P50148	359 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	FOSB	P53539	338 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	SEPT2	Q15019	361 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	WASF1	Q92558	559 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	MKL1	Q969V6	931 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	AIFM3	Q96NN9	605 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	CABP5	Q9NP86	173 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	GH2	P01242	217 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CAPNS1-215	ENST00000628018	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		28.89	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	GGA3	Q9NZ52	723 aa		28.89	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	SNHG28	P0DPA3	235 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYH6	P13533	1939 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	PDHB	P11177	359 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	GUCY1B3	Q02153	619 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	ICA1	Q05084	483 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	REST	Q13127	1097 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	NBR1	Q14596	966 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	MTMR7	Q9Y216	660 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	PKN1	Q16512	942 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	GLTPD2	A6NH11	291 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP17L5	A8MUK1	530 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	CAP2	P40123	477 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATP2B2	Q01814	1243 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	MCTP1	Q6DN14	999 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	KLRF2	D3W0D1	207 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	KRT40	Q6A162	431 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMARCA1	P28370	1054 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CAPNS1-215	ENST00000628018	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CYTH3	O43739	400 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRIM29	Q14134	588 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	HOOK2	Q96ED9	719 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF543	Q08ER8	600 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DCAF15	Q66K64	600 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ASNS	P08243	561 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SCN4A	P35499	1836 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018		A0A1W2PRG0	241 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	GINM1	Q9NU53	330 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TCHH	Q07283	1943 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SCG2	P13521	617 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PTMS	P20962	102 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	EPHX2	P34913	555 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DCAF4	Q8WV16	495 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SHISA4	Q96DD7	197 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018		F5H6K3	240 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	MMP1	P03956	469 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	XBP1	P17861	261 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	KLRC3	Q07444	240 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLFN13	Q68D06	897 aa		28.77	■■■□□ 2.2

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