RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-231ENST00000600201 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-231ENST00000600201 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-231ENST00000600201 PFASO15067 1338 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-231ENST00000600201 DNAH12Q6ZR08 3092 aa17.9■□□□□ 0.46
FCHO1-231ENST00000600201 UBE3CQ15386 1083 aa17.9■□□□□ 0.46
FCHO1-231ENST00000600201 PTPREP23469 700 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 RGS2P41220 211 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 MAP2K5Q13163 448 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 CTR9Q6PD62 1173 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 LBX2Q6XYB7 198 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 C7orf61Q8IZ16 206 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 OSBP2Q969R2 916 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 APBA2Q99767 749 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 DCTPP1Q9H773 170 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 OGDHLQ9ULD0 1010 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 M0R2C6 588 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 EVI5O60447 810 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ICA1Q05084 483 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 LHX8Q68G74 356 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 C16orf86Q6ZW13 317 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 TRPV1Q8NER1 839 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ATG4CQ96DT6 458 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ECHDC1Q9NTX5 307 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 SYN1P17600 705 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 GRB14Q14449 540 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 NECAB2Q7Z6G3 386 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 SWAP70Q9UH65 585 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 SMCHD1A6NHR9 2005 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 GSG1L2A8MUP6 293 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 CYP2C19P33261 490 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 STAP2Q9UGK3 403 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 TMX2Q9Y320 296 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 COBLO75128 1261 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 IGHA2P01877 340 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 DSG3P32926 999 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ATP2B2Q01814 1243 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 KBTBD3Q8NAB2 608 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 C11orf49Q9H6J7 331 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 VCPKMTQ9H867 229 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 FLOT1O75955 427 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ERCC3P19447 782 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 RASA1P20936 1047 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 CCNA1P78396 465 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 COG2Q14746 738 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ANO1Q5XXA6 986 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 ANKLE1Q8NAG6 615 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 PI4K2BQ8TCG2 481 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 NR2E3Q9Y5X4 410 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 MCM3APO60318 1980 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-231ENST00000600201 GPAA1O43292 621 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 COL6A1P12109 1028 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 ADORA2AP29274 412 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 PLS1Q14651 629 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 LRRC26Q2I0M4 334 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 NBPF3Q9H094 633 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 LTBP2Q14767 1821 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 ROBO3Q96MS0 1386 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 MINDY4BA8MYZ0 360 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 HOXC6P09630 235 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 APPBP2Q92624 585 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 LRCH3Q96II8 777 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 CRBNQ96SW2 442 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 RAD21O60216 631 aa17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 PRDM1O75626 825 aa17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 CYBAP13498 195 aa17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 RRP1P56182 461 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC17Q96LX7 622 aa17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa17.81■□□□□ 0.44
FCHO1-231ENST00000600201 SALL3Q9BXA9 1300 aa17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms