RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 IFNAR1P17181 557 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 XBP1P17861 261 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 GSDMDP57764 484 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ITPK1Q13572 414 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC39A14Q15043 492 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT40Q6A162 431 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ESR2Q92731 530 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 TOMM22Q9NS69 142 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP131Q9UPN4 1083 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CLIC4Q9Y696 253 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GUL6 1792 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 AP5Z1O43299 807 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CUTAO60888 179 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 DEXIO95424 95 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 AVPP01185 164 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CALM1P0DP23 149 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CALM2P0DP24 149 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CALM3P0DP25 149 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP7A1P22680 504 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PTGS1P23219 599 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFA8P51970 172 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PPARAQ07869 468 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM32Q13049 653 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCB1Q15051 598 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 Q3C1V9 767 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 LCORLQ8N3X6 602 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MYRIPQ8NFW9 859 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC31BQ9NQW1 1179 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 RAI14Q9P0K7 980 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ANAPC4Q9UJX5 808 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 COL24A1Q17RW2 1714 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GVL5 298 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF28PB7ZC32 967 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PFKFB1P16118 471 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SYKP43405 635 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP12P59046 1061 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 RILPL1Q5EBL4 403 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC186Q7Z3E2 898 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC150Q8NCX0 1101 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 BRIP1Q9BX63 1249 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNF1Q9H3M0 494 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 BRMS1Q9HCU9 246 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 IMPACTQ9P2X3 320 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 DUOX1Q9NRD9 1551 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CBFA2T2O43439 604 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF202O95125 648 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 BMP15O95972 392 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 SMPD1P17405 629 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 NTRK3Q16288 839 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 AOPEPQ8N6M6 819 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 J3QL48 77 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 WNT7AO00755 349 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 IKBKBO14920 756 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 PPFIA3O75145 1194 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 DDAH1O94760 285 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 MMP1P03956 469 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC27P30260 824 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms