RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 STAG2Q8N3U4 1231 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 C8orf76Q96K31 380 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 NYAP2Q9P242 653 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 GH2P01242 217 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 FERMT3Q86UX7 667 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 MKL1Q969V6 931 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 GJB4Q9NTQ9 266 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 MYH6P13533 1939 aa30.23■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 DEXIO95424 95 aa30.22■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 NBR1Q14596 966 aa30.22■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 GGA3Q9NZ52 723 aa30.22■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 SNHG28P0DPA3 235 aa30.21■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 GUCY1B3Q02153 619 aa30.21■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa30.21■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 DPY19L2Q6NUT2 758 aa30.21■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 EEF2P13639 858 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 RESTQ13127 1097 aa30.2■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 WASF1Q92558 559 aa30.2■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 MTMR7Q9Y216 660 aa30.2■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa30.2■■■□□ 2.43
SCAMP4-210ENST00000588555 PDHBP11177 359 aa30.2■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 GNAQP50148 359 aa30.2■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ICA1Q05084 483 aa30.2■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 PKN1Q16512 942 aa30.2■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 CABP5Q9NP86 173 aa30.2■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC35G1Q2M3R5 365 aa30.19■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 USP17L5A8MUK1 530 aa30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 V9GY48 417 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP2B2Q01814 1243 aa30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 MCTP1Q6DN14 999 aa30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa30.18■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX11L8A8MPP1 907 aa30.17■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA8HP0CJ92 632 aa30.17■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 CAP2P40123 477 aa30.17■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 TCHHQ07283 1943 aa30.16■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 GLTPD2A6NH11 291 aa30.16■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT40Q6A162 431 aa30.16■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 LZTS2Q9BRK4 669 aa30.16■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa30.15■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 KLRF2D3W0D1 207 aa30.15■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 CYTH3O43739 400 aa30.15■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa30.15■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 SPZ1Q9BXG8 430 aa30.15■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ASPRV1Q53RT3 343 aa30.14■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM173BQ6P4H8 233 aa30.14■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 SHISA4Q96DD7 197 aa30.14■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ATAD5Q96QE3 1844 aa30.14■■■□□ 2.42
SCAMP4-210ENST00000588555 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA6L22H0YM25 854 aa30.13■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SMARCA1P28370 1054 aa30.13■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF543Q08ER8 600 aa30.13■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa30.13■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 MYH15Q9Y2K3 1946 aa30.13■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1W2PRG0 241 aa30.12■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM29Q14134 588 aa30.12■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 CPVLQ9H3G5 476 aa30.12■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SSC5DA1L4H1 1573 aa30.12■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.11■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa30.11■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SCN4AP35499 1836 aa30.11■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 CNPY2Q9Y2B0 182 aa30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF28PB7ZC32 967 aa30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 MMP1P03956 469 aa30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ASNSP08243 561 aa30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SCG2P13521 617 aa30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 DCAF15Q66K64 600 aa30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 HOOK2Q96ED9 719 aa30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 LMBRD1Q9NUN5 540 aa30.1■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 EPHX2P34913 555 aa30.09■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 DCAF4Q8WV16 495 aa30.09■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 RIOX1Q9H6W3 641 aa30.09■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNJ14Q9UNX9 436 aa30.09■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 F5H6K3 240 aa30.08■■■□□ 2.41
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