RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	ETV3	P41162	512 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FXN	Q16595	210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494		B2RBV5	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	GSC2	O15499	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRRN2	O75325	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	EOMES	O95936	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAB33A	Q14088	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	GATA6	Q92908	595 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67	8e-8	■■■■□ 26.2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCNF	P41002	786 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CASP7	P55210	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	RNF4	P78317	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	RBL2	Q08999	1139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494		C9IYK1	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP26A1	O43174	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLF4	O43474	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	GJB6	O95452	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDR2	Q16832	855 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	NCAPH	Q15003	741 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FGD4	Q96M96	766 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	MEIS1	O00470	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	TGFB1	P01137	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SV2C	Q496J9	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	HAUS7	Q99871	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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