RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	GFRA2	O00451	464 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	JAG1	P78504	1218 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PKN1	Q16512	942 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNMB1	Q16558	191 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC120	Q96HB5	630 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PRR33	A8MZF0	331 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	AFM	P43652	599 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK8	P49336	464 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PDE4B	Q07343	736 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC38A3	Q99624	504 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		6.13	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PGR	P06401	933 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ETV3	P41162	512 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMD2	Q13200	908 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP3K11	Q16584	847 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC6A19	Q695T7	634 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	KSR1	Q8IVT5	923 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	NUP155	O75694	1391 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289		H3BS24	57 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CBX7	O95931	251 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	DAB2	P98082	770 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	RIN3	Q8TB24	985 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM87B	Q96K49	555 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PARP2	Q9UGN5	583 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	PZP	P20742	1482 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC7	Q96M83	1385 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	GDNF	P39905	211 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM84A	Q96KN4	292 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF19A	Q9NV58	838 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	KDM6B	O15054	1643 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	SHROOM2	Q13796	1616 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	DBX1	A6NMT0	343 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	TMC4	Q7Z404	712 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH24	Q86UP0	819 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2F	Q969M7	185 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	KIRREL1	Q96J84	757 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PTPRM-215	ENST00000583289	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PTPRM-215	ENST00000583289	USP31	Q70CQ4	1352 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF15	Q9NS87	1388 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PTPRM-215	ENST00000583289	BPNT1	O95861	308 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PTPRM-215	ENST00000583289	GLI1	P08151	1106 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	6.08	□□□□□ -1.44

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