RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579814.1

LIMD2-208, Transcript of LIM domain containing 2, human

TSL 2

Gene LIMD2, Length 709 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIMD2-208	ENST00000579814	COG2	Q14746	738 aa		31.23	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814		Q3C1V9	767 aa		31.23	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	31.23	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		31.23	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	MAPK4	P31152	587 aa		31.22	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	UBXN2A	P68543	259 aa		31.22	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	LBX2	Q6XYB7	198 aa		31.22	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		31.22	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	HTT	P42858	3142 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	PRDM1	O75626	825 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	CCNA1	P78396	465 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	GOPC	Q9HD26	462 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		31.2	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814		A0A0D9SFI3	127 aa		31.2	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	SDS	P20132	328 aa		31.2	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	GJD2	Q9UKL4	321 aa		31.2	■■■□□ 2.59
LIMD2-208	ENST00000579814	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	FOXP2	O15409	715 aa		31.19	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	ALX1	Q15699	326 aa		31.19	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	VPS53	Q5VIR6	699 aa		31.19	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	NYAP2	Q9P242	653 aa		31.19	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	CNMD	O75829	334 aa		31.18	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	RAD21	O60216	631 aa		31.17	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	ELN	P15502	786 aa		31.17	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	MTFR1	Q15390	333 aa		31.17	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		31.17	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	PORCN	Q9H237	461 aa		31.17	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	HIP1	O00291	1037 aa		31.16	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	FLOT1	O75955	427 aa		31.16	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	TSPY3	P0CV98	308 aa		31.16	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	TSPY8	P0CW00	308 aa		31.16	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		31.16	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		31.16	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	BTBD7	Q9P203	1132 aa		31.16	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	DSG3	P32926	999 aa		31.15	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	GPR142	Q7Z601	462 aa		31.15	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		31.15	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		31.15	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		31.15	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		31.15	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	FGA	P02671	866 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	CCL5	P13501	91 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	PDE4A	P27815	886 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	TFAP4	Q01664	338 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	MB21D1	Q8N884	522 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	RNF208	Q9H0X6	261 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		31.14	■■■□□ 2.58
LIMD2-208	ENST00000579814	INHA	P05111	366 aa		31.13	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		31.13	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		31.13	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	CEP95	Q96GE4	821 aa		31.13	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		31.13	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	TTLL1	O95922	423 aa		31.12	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	CYP2B6	P20813	491 aa		31.12	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	WDR78	Q5VTH9	848 aa		31.12	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		31.12	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	MKL1	Q969V6	931 aa		31.12	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814		F5H6K3	240 aa		31.11	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	KLRC3	Q07444	240 aa		31.11	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		31.11	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	31.11	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		31.1	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	ATG4C	Q96DT6	458 aa		31.1	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		31.1	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	TSPY2	A6NKD2	308 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	HMGCR	P04035	888 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	GJB1	P08034	283 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	RGS2	P41220	211 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	MORN1	Q5T089	497 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	TTC22	Q5TAA0	569 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	INCENP	Q9NQS7	918 aa		31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	ZMYM6	O95789	1325 aa		31.08	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	USP6NL	Q92738	828 aa		31.08	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
LIMD2-208	ENST00000579814	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		31.07	■■■□□ 2.56
LIMD2-208	ENST00000579814	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
LIMD2-208	ENST00000579814	NDUFB10	O96000	172 aa		31.07	■■■□□ 2.56
LIMD2-208	ENST00000579814	PTPRE	P23469	700 aa		31.07	■■■□□ 2.56
LIMD2-208	ENST00000579814	PLS1	Q14651	629 aa		31.07	■■■□□ 2.56
LIMD2-208	ENST00000579814	TOMM22	Q9NS69	142 aa		31.07	■■■□□ 2.56

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