RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 TTC6Q86TZ1 520 aa11.14□□□□□ -0.63
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PTPRM-210ENST00000578916 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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PTPRM-210ENST00000578916 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.642e-8■■■□□ 18.6
PTPRM-210ENST00000578916 TINF2Q9BSI4 451 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 PRDM12Q9H4Q4 367 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.08□□□□□ -0.64
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