RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 RAD21O60216 631 aa25.04■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 TTC22Q5TAA0 569 aa25.04■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.04■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 GABRQQ9UN88 632 aa25.04■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.04■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 TSPY3P0CV98 308 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 TSPY8P0CW00 308 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 RGS19P49795 217 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 ERVK-9P63128 1117 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 ERVK-24P63145 666 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 COG2Q14746 738 aa25.03■■□□□ 1.6
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SNAP23-216ENST00000568331 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.03■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 GRK4P32298 578 aa25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 FLT3LGP49771 235 aa25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF333Q96JL9 665 aa25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 NYAP2Q9P242 653 aa25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 HTTP42858 3142 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 PEX10O60683 326 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 FGAP02671 866 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 MAPK4P31152 587 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 CCNA1P78396 465 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 TFAP4Q01664 338 aa25■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 Q3C1V9 767 aa25■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 LBX2Q6XYB7 198 aa25■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 NEDD1Q8NHV4 660 aa25■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 ZMYM6O95789 1325 aa25■■□□□ 1.59
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SNAP23-216ENST00000568331 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 IRF5Q13568 498 aa24.99■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.99■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 CEP95Q96GE4 821 aa24.99■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.98■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 TSPY2A6NKD2 308 aa24.98■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 TTLL1O95922 423 aa24.98■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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SNAP23-216ENST00000568331 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.98■■□□□ 1.59
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SNAP23-216ENST00000568331 TOMM22Q9NS69 142 aa24.98■■□□□ 1.59
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SNAP23-216ENST00000568331 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
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SNAP23-216ENST00000568331 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.97■■□□□ 1.59
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SNAP23-216ENST00000568331 WDR78Q5VTH9 848 aa24.96■■□□□ 1.59
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SNAP23-216ENST00000568331 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.96■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 MB21D1Q8N884 522 aa24.96■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.96■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 PORCNQ9H237 461 aa24.96■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 INCENPQ9NQS7 918 aa24.96■■□□□ 1.59
SNAP23-216ENST00000568331 BTBD7Q9P203 1132 aa24.96■■□□□ 1.59
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SNAP23-216ENST00000568331 F5H6K3 240 aa24.95■■□□□ 1.58
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SNAP23-216ENST00000568331 ELNP15502 786 aa24.95■■□□□ 1.58
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SNAP23-216ENST00000568331 KLRC3Q07444 240 aa24.95■■□□□ 1.58
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SNAP23-216ENST00000568331 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.95■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 MKL1Q969V6 931 aa24.95■■□□□ 1.58
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SNAP23-216ENST00000568331 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.95■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 GPR142Q7Z601 462 aa24.94■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.94■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 GJD2Q9UKL4 321 aa24.94■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 CENPFP49454 3210 aa24.93■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 LAMA4Q16363 1823 aa24.93■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 POTEFA5A3E0 1075 aa24.93■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF213O14771 459 aa24.93■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 NDUFB10O96000 172 aa24.93■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 NEFLP07196 543 aa24.93■■□□□ 1.58
SNAP23-216ENST00000568331 PLS1Q14651 629 aa24.93■■□□□ 1.58
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