RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565589.5

RNPS1-215, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-215	ENST00000565589	TMX2	Q9Y320	296 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	PTPRF	P10586	1907 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	SYN1	P17600	705 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ATP5J	P18859	108 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ADORA2A	P29274	412 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	SEPT2	Q15019	361 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	CCL14	Q16627	93 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ACER1	Q8TDN7	264 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	LRCH3	Q96II8	777 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	VCPKMT	Q9H867	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	BTBD7	Q9P203	1132 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	FLOT1	O75955	427 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	CYBA	P13498	195 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ERCC3	P19447	782 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	GUCY1A2	P33402	732 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	RNF180	Q86T96	592 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNPS1-215	ENST00000565589	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	GOLIM4	O00461	696 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	FDX1	P10109	184 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	RARB	P10826	455 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	RLBP1	P12271	317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	ADD2	P35612	726 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	ICA1	Q05084	483 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	KCTD2	Q14681	263 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	SNX17	Q15036	470 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	C12orf60	Q5U649	245 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	HAUS7	Q99871	368 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589		A0A1W2PRG0	241 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	GNAT2	P19087	354 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	CYP2C19	P33261	490 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	STAT3	P40763	770 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	CDK8	P49336	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	RTP1	P59025	263 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	PLS1	Q14651	629 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	CCDC174	Q6PII3	467 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	GPATCH3	Q96I76	525 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	MAML3	Q96JK9	1138 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	TOX2	Q96NM4	488 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	LAMA3	Q16787	3333 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	PEX10	O60683	326 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	AKR1A1	P14550	325 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	SBK1	Q52WX2	424 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	MMP19	Q99542	508 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	SPC25	Q9HBM1	224 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	USP17L12	C9JPN9	530 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	USP17L21	D6R901	530 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	VWA5A	O00534	786 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNPS1-215	ENST00000565589	ATP2A1	O14983	1001 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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