RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF5BP33176 963 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP28Q96RU2 1077 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 VEZTQ9HBM0 779 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELP1O95163 1332 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SBF1O95248 1867 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM196BA6NMK8 535 aa20.62■□□□□ 0.89
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USP3-AS1-208ENST00000560962 PKN1Q16512 942 aa20.62■□□□□ 0.89
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USP3-AS1-208ENST00000560962 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPC2Q8N158 579 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTLL1O95922 423 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATL3Q6DD88 541 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 MMP1P03956 469 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNAQP50148 359 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNNI2P48788 182 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 PGBD1Q96JS3 809 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTBD18B2RXH4 712 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 H7C1D1 291 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D12O60347 775 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFAIP1Q13829 316 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHISA4Q96DD7 197 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLIC4Q9Y696 253 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 XBP1P17861 261 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF181Q9P0P0 153 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K10Q02779 954 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 NYAP2Q9P242 653 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L5A8MUK1 530 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNHG28P0DPA3 235 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASA3Q14644 834 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 OXER1Q8TDS5 423 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 MKL1Q969V6 931 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYCE3A1L190 88 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 FSD2A1L4K1 749 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDHBP11177 359 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCG2P13521 617 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 LIG1P18858 919 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF445P59923 1031 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP2B2Q01814 1243 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 STK38Q15208 465 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPVLQ9H3G5 476 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 HACL1Q9UJ83 578 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLRF2D3W0D1 207 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 GDF11O95390 407 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMARCA1P28370 1054 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 NR5A1Q13285 461 aa20.54■□□□□ 0.88
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