RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 FOXQ1Q9C009 403 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PTPRGP23470 1445 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 AGRPO00253 132 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 CLEC3AO75596 197 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 LRIG2O94898 1065 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 UBOX5O94941 541 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 SQSTM1Q13501 440 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 MAPKBP1O60336 1514 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 CUL7Q14999 1698 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 DRD2P14416 443 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 TREML4Q6UXN2 200 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 Q6ZS46 218 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM192Q8IY95 271 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 SGSM3Q96HU1 749 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 NACC1Q96RE7 527 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 FEZ1Q99689 392 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PREPP48147 710 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 RNF4P78317 190 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 TCEA2Q15560 299 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 UVSSAQ2YD98 709 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 HAUS7Q99871 368 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 GLB1P16278 677 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 RAB6AP20340 208 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 PTPROQ16827 1216 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 USP21Q9UK80 565 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 C9orf172C9J069 976 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJC6O75061 913 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 USP11P51784 963 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 GRIK4Q16099 956 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 GBP3Q9H0R5 595 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 ADCY3O60266 1144 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 APBA3O96018 575 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 ETV3P41162 512 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 SV2CQ496J9 727 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 APBA2Q99767 749 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 SPC25Q9HBM1 224 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 C9IYK1 514 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-208ENST00000560725 WIPF1O43516 503 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms