RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556687.5

RBM23-222, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-222	ENST00000556687	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	TMX2	Q9Y320	296 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PLXNB2	O15031	1838 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	FOXP2	O15409	715 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PRDM1	O75626	825 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	ATP2B2	Q01814	1243 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	IRF5	Q13568	498 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	BTBD7	Q9P203	1132 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	RLF	Q13129	1914 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	CCL5	P13501	91 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	VPS53	Q5VIR6	699 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	FAM227B	Q96M60	508 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	NAPB	Q9H115	298 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	VCPKMT	Q9H867	229 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	BRCA2	P51587	3418 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	UBXN2A	P68543	259 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	COG2	Q14746	738 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	LBX2	Q6XYB7	198 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	RILPL2	Q969X0	211 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687		A0A0D9SFI3	127 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	INHA	P05111	366 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	CYP2B6	P20813	491 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	MAPK4	P31152	587 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PPARA	Q07869	468 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	RNF208	Q9H0X6	261 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	SH2D4A	Q9H788	454 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	INCENP	Q9NQS7	918 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	DSG3	P32926	999 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	TRIM32	Q13049	653 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	GPR142	Q7Z601	462 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	LPAR1	Q92633	364 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	USP6NL	Q92738	828 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	SHISA4	Q96DD7	197 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	NYAP2	Q9P242	653 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PARP14	Q460N5	1801 aa		14.59	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	RAD21	O60216	631 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	FLOT1	O75955	427 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	GJB1	P08034	283 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	SDS	P20132	328 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	PDE4A	P27815	886 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	MORN1	Q5T089	497 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	ATG4C	Q96DT6	458 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	MYH4	Q9Y623	1939 aa		14.58	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	GJA8	P48165	433 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	CCNA1	P78396	465 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	TFAP4	Q01664	338 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	PDE4B	Q07343	736 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	ALX1	Q15699	326 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	WDR78	Q5VTH9	848 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	TICAM2	Q86XR7	235 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	TRIB2	Q92519	343 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	CEP95	Q96GE4	821 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	GOPC	Q9HD26	462 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687		F5H6K3	240 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	FGA	P02671	866 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	HMGCR	P04035	888 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
RBM23-222	ENST00000556687	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08

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