RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.53■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.53■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.53■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 PTPREP23469 700 aa20.52■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 GRB14Q14449 540 aa20.52■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.52■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 GDF15Q99988 308 aa20.52■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.52■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 SWAP70Q9UH65 585 aa20.52■□□□□ 0.88
TMX1-202ENST00000555574 CHGBP05060 677 aa20.51■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 COL6A1P12109 1028 aa20.51■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 ATP5JP18859 108 aa20.51■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.51■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.51■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 HAUS7Q99871 368 aa20.51■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 SMIM22K7EJ46 135 aa20.5■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.5■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 LRCH3Q96II8 777 aa20.5■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.5■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 HOXC6P09630 235 aa20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 AKR1B1P15121 316 aa20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 ATP2B2Q01814 1243 aa20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 COG2Q14746 738 aa20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.49■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 CYP2C19P33261 490 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 BMP8BP34820 402 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 ICA1Q05084 483 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.48■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.47■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 ADORA2AP29274 412 aa20.47■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 CNGA1P29973 690 aa20.47■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 UBE3CQ15386 1083 aa20.47■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.47■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 LPAR1Q92633 364 aa20.47■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.47■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 USP17L12C9JPN9 530 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 USP17L21D6R901 530 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 FLOT1O75955 427 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 ERCC3P19447 782 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 CDK8P49336 464 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 C12orf60Q5U649 245 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 TRPV1Q8NER1 839 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 VCPKMTQ9H867 229 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 TMX2Q9Y320 296 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX1-202ENST00000555574 IGHA2P01877 340 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 CYBAP13498 195 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 DSG3P32926 999 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 PLS1Q14651 629 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 DPP9Q86TI2 863 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 MB21D1Q8N884 522 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 ATG4CQ96DT6 458 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 CCDC17Q96LX7 622 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 SH2D4AQ9H788 454 aa20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 MSCO60682 206 aa20.44■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.44■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 COL6A3P12111 3177 aa20.43■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 STRNO43815 780 aa20.43■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.43■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 CTR9Q6PD62 1173 aa20.43■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.43■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.42■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 COBLO75128 1261 aa20.42■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 TDHQ8IZJ6 230 aa20.42■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 MROH8Q9H579 483 aa20.42■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 DNM1LO00429 736 aa20.41■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.41■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 LTBP2Q14767 1821 aa20.4■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.4■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 ANO1Q5XXA6 986 aa20.4■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.4■□□□□ 0.86
TMX1-202ENST00000555574 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms