RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 TANGO6Q9C0B7 1094 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 NAV1Q8NEY1 1877 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 LTBP2Q14767 1821 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 DNM1LO00429 736 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 HOXC6P09630 235 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 CYP2D6P10635 497 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 CYBAP13498 195 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 MAP3K12Q12852 859 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 PLS1Q14651 629 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 SHHQ15465 462 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 AACSQ86V21 672 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 CLEC10AQ8IUN9 316 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 RLFQ13129 1914 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-227ENST00000551441 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 COBLO75128 1261 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ERCC3P19447 782 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ZNF697Q5TEC3 545 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 LBX2Q6XYB7 198 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SLC44A5Q8NCS7 719 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 BADQ92934 168 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 MSCO60682 206 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 RLBP1P12271 317 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 TRIM60Q495X7 471 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SDR42E1Q8WUS8 393 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 DYNLL2Q96FJ2 89 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SPATC1LQ9H0A9 340 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 MCM9Q9NXL9 1143 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 KBTBD13C9JR72 458 aa19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 APBB1O00213 710 aa19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ADCYAP1R1P41586 468 aa19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 COG2Q14746 738 aa19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SLFNL1Q499Z3 407 aa19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 NCAPG2Q86XI2 1143 aa19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SPICE1Q8N0Z3 855 aa19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SMIM22K7EJ46 135 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 IGHA2P01877 340 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 GABPAQ06546 454 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ARRDC4Q8NCT1 418 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ATG4CQ96DT6 458 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 PDE6AP16499 860 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 FAM47AQ5JRC9 791 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 CERS3Q8IU89 383 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 LCORLQ8N3X6 602 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 MYLIPQ8WY64 445 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 HOXC10Q9NYD6 342 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 VCANP13611 3396 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ZNF532Q9HCE3 1301 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 TRIM43BA6NCK2 446 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SEPT4O43236 478 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 DSG3P32926 999 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 LRRC41Q15345 812 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 OLFML2BQ68BL8 750 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 CEP85Q6P2H3 762 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 SEMA6BQ9H3T3 888 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 PDLIM7Q9NR12 457 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 MYH8P13535 1937 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 A0A0G2JMZ2 1700 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 GOLIM4O00461 696 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 PRKAB2O43741 272 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 IGSF3O75054 1194 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 FLOT1O75955 427 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 AKR1B1P15121 316 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ARMT1Q9H993 441 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 ZNF236Q9UL36 1845 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-227ENST00000551441 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 STRNO43815 780 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 PGK2P07205 417 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 ITGB8P26012 769 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 SIAH1Q8IUQ4 282 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 MAML3Q96JK9 1138 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 CHGBP05060 677 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 TLE2Q04725 743 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 SHCBP1Q8NEM2 672 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 CCER2I3L3R5 266 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-227ENST00000551441 RAD21O60216 631 aa19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms