RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC10A3	P09131	477 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	GSDMD	P57764	484 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CXCL9	Q07325	125 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SEC23A	Q15436	765 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CAMK4	Q16566	473 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	AOC3	Q16853	763 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442		H7C1D1	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF202	O95125	648 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CALML3	P27482	149 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SYK	P43405	635 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	GYG1	P46976	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	TNIP1	Q15025	636 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CDC27	P30260	824 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	NLRP12	P59046	1061 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	IQCB1	Q15051	598 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	TNKS	O95271	1327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF75D	P51815	510 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	MECOM	Q03112	1051 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPA	Q15257	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24	7e-7	■■■■■ 30.2
LETMD1-223	ENST00000550442	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	RAD17	O75943	681 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPRE	P23469	700 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	NDUFA8	P51970	172 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-223	ENST00000550442	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKAB2	O43741	272 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-223	ENST00000550442	IL1R1	P14778	569 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT2	P35908	639 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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